全然問題ありません。
　ソフトウエア企業が何らかの問題を持っていたり、ある観点で係争していたとしても、その企業のソフトを利用すること自体は、全く問題になりません。自由に利用し、活用してください。では、ナプスタや、グニュテラといったＭＰ３ファイルの発見、公開、転送のためのソフトウエア自体が疑問視されている場合はどうでしょうか。ナプスタサイトは違法だとして訴えられていますが、アメリカの地裁では停止命令がでたものの、高裁ではその命令が延期されたのですから、現時点ではそのサイトも自由に利用できます。こうして、企業やサイトが問題ないなっても、そのこと自体争いの対象となり、結果は見えないことが多いのです。従って、最終決定がでるまでは、このサイトもソフトも自由に利用していいわけです。ご質問の場合は、むしろソフトウエアの問題ではなく、企業活動の問題なので、ソフトの利用を制限する根拠は全くありません。いずれにしても自由に利用していただいて結構です。